Турнир проводится с 1996-го года. Вплоть до 2002-го года он назывался Всероссийским турниром среди мужских команд железнодорожников и транспортных строителей на призы МПС РФ. В 2003 году турнир не состоялся, а со следующего года получил новое название - Кубок президента ОАО «РЖД».
С 1996 по 2002 год чемпионами становились либо команда Красноярской железной дороги, либо Западно-Сибирской. Они были на голову сильнее своих соперников. С 2007-го года в борьбу за трофей вступили коллективы Дальневосточной, Свердловской и Восточно-Сибирской магистралей.
Долгое время турнир проводился в Красноярке, но в 2008 году Кубок президента ОАО «РЖД» перенесли в Екатеринбург в связи со 130-летием Свердловской железной дороги. В тот год победу одержали хозяева. Год спустя в Кубке участвовали лишь 12 команд. Не приехали в Красноярск железнодорожники Юго-Восточной, Северо-Кавказской, Сахалинской, Калининградской и Дальневосточной магистралей. Второй раз подряд обладателями кубка стали волейболисты из Екатеринбурга.
На следующий год ситуация повторилась. В финале снова сошлись Свердловская и Красноярская команды, и в третий раз подряд красноярцы уступили. Любопытно, что в матче за третье место в эти годы складывалась похожая картина. Между собой спорили Восточно-Сибирская и Забайкальская дороги, и оба раза сильнее оказывались сибиряки.
В 2011-м году впервые в своей истории победу в Кубке президента одержала команда ВСЖД. Трое игроков этой команды вошли в состав сборной ОАО «РЖД», которая победила на чемпионате МССЖ по волейболу, проходившем в октябре того года в Екатеринбурге.
Через год команда Восточно-Сибирской дороги подтвердила свой успех уже у себя дома. Турнир проводился на озере Байкал на базе МЧС РФ. В том же году было принято решение о пересмотре практики проведения последующих турниров на дорогах, чьи команды становились победителями. Это позволило существенно расширить географию проведения одного из самых престижных турниров в любительском железнодорожном спорте.
В 2013-м году Кубок президента ОАО «РЖД» проводился в самой западной части страны – в Калининграде. Тогда в самом длинном финале в истории турнира победу праздновали представители Красноярской магистрали. Они оказались сильнее дальневосточников, которые трижды (!) за последние три года выходили в финал, но довольствовались лишь серебряными медалями.
За время проведения турнира его гостями были президент ОАО «РЖД» Владимир Якунин, губернаторы, начальники дорог, министры спорта областей и краев.
С 6 по 10 апреля в Санкт-Петербурге прошел Кубок президента ОАО «РЖД» по волейболу. В нем приняли участие 16 команд, представляющие все железные дороги страны.
Все участники разделены на четыре группы по четыре команды в каждой. В первый день турнира состоялись матчи группового этапа. Команды сыграли в один круг. Шестнадцать команд «змейкой» с учетом мест занятых командами в Кубке президента ОАО «РЖД» 2013 года были разделены на соответствующие «четверки».
На второй день начались матчи финального этапа. Особенность турнира такова, что в нем разыгрываются все места, поэтому главные матчи состоялись 9 апреля. Сначала были сыграны полуфиналы, затем матчи за 5-16 места. Последними были сыграны матчи: за третье место и финал.
В 2014-м году победителем стала команда Красноярской магистрали. В финале она обыграла свердловчан.